Fue inaugurado en el año de 1993 ycomparte el espacio con la biblioteca de unedificio construido en 1944 para servir deescuela.

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El exterior, del que destaca su pórtico, es una versión provinciana del art decó, muy usada en la época del nacionalismo artístico mexicano. El interior, sin embargo, se resuelve a la manera tradicional de Comitán: un patio rodeado de corredores. Un busto del músico Esteban Alfonso adorna el patio.

 

Este museo difunde el desarrollo de las culturas prehispánicas en la región de Los Llanos hasta la llegada de los españoles, con base en los siguientes periodos: Prehistórico, Preclásico, Clásico, Posclásico y la Sala de Tenam Puente la cual fue creada para exhibir los materiales encontrados durante las excavaciones de la zona arqueológica que lleva este nombre en la década de los noventa y que se encuentra a unos cuantos minutos de la Ciudad de Comitán.

 

El apogeo de este sitio arqueológico, en el clásico tardío, se extendió hasta el posclásico temprano.